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Processing temporal information in unstructured documents

Tue, 01 Jan 2013 00:00:00 GMT

Title: Processing temporal information in unstructured documents Authors: Costa, Francisco Nuno Quintiliano Mendonça Carapeto, 1980- Abstract: Temporal information processing has received substantial attention in the last few years, due to the appearance of evaluation challenges focused on the extraction of temporal information from texts written in natural language. This research area belongs to the broader field of information extraction, which aims to automatically find specific pieces of information in texts, producing structured representations of that information, which can then be easily used by other computer applications. It has the potential to be useful in several applications that deal with natural language, given that many languages, among which we find Portuguese, extensively refer to time. Despite that, temporal processing is still incipient for many language, Portuguese being one of them. The present dissertation has various goals. On one hand, it addresses this current gap, by developing and making available resources that support the development of tools for this task, employing this language, and also by developing precisely this kind of tools. On the other hand, its purpose is also to report on important results of the research on this area of temporal processing. This work shows how temporal processing requires and benefits from modeling different kinds of knowledge: grammatical knowledge, logical knowledge, knowledge about the world, etc. Additionally, both machine learning methods and rule-based approaches are explored and used in the development of hybrid systems that are capable of taking advantage of the strengths of each of these two types of approach.; O processamento de informação temporal tem recebido bastante atenção nos últimos anos, devido ao surgimento de desafios de avaliação focados na extração de informação temporal de textos escritos em linguagem natural. Esta área de investigação enquadra-se no campo mais lato da extração de informação, que visa encontrar automaticamente informação específica presente em textos, produzindo representações estruturadas da mesma, que podem depois ser facilmente utilizadas por outras aplicações computacionais. Tem o potencial de ser útil em diversas aplicações que lidam com linguagem natural, dado o caráter quase ubíquo da referência ao tempo cronólogico em muitas línguas, entre as quais o Português. Apesar de tudo, o processamento temporal encontra-se ainda incipiente para bastantes línguas, sendo o Português uma delas. A presente dissertação tem vários objetivos. Por um lado vem colmatar esta lacuna existente, desenvolvendo e disponibilizando recursos que suportam o desenvolvimento de ferramentas para esta tarefa, utilizando esta língua, e desenvolvendo também precisamente este tipo de ferramentas. Por outro serve também para relatar resultados importantes da pesquisa nesta área do processamento temporal. Neste trabalho, mostra- -se como o processamento temporal requer e beneficia da modelação de conhecimento de diversos níveis: gramatical, lógico, acerca do mundo, etc. Adicionalmente, são explorados tanto métodos de aprendizagem automática como abordagens baseadas em regras, desenvolvendo-se sistemas híbridos capazes de tirar partido das vantagens de cada um destes dois tipos de abordagem. Description: Tese de doutoramento, Informática (Ciência da Computação), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2013

Bioactividade do mel: actividade antioxidante, antimicrobiana e composição em ácidos orgânicos

Fri, 01 Jan 2010 00:00:00 GMT

Title: Bioactividade do mel: actividade antioxidante, antimicrobiana e composição em ácidos orgânicos Authors: Lopes, Marina Filipa Paixão Domingos Abstract: O mel tem sido alvo de vários estudos sobre a sua composição e propriedades, indicando que alguns méis de diferentes origens possuem propriedades antimicrombianas e antioxidantes específicas, que variam de acordo com a sua origem floral. Os Açores com a sua flora endémica são propícios para a produção de mel. No entanto, existem poucos estudos que caracterizam os méis açorianos. Deste modo, foram analisadas 27 amostras de mel de diferentes ilhas dos Açores, de Portugal continental, Austrália, Argentina e Nova Zelândia, avaliando-se a sua composição em fenóis totais e avaliando-se a actividade antioxidante através do método de avaliação da capacidade de captação de radicais (DPPH) e do poder antioxidante pela redução de ferro (FRAP). Foram avaliados a actividade da água (aw), pH e cor, e analisados os ácidos orgânicos (fórmico, D-málico, láctico, acético, maleico, cítrico, succínico e fumárico) por cromatografia Liquida de Alta Pressão (HPLC) e o ácido glucónico total (ácido D-glucónico livre e D-glucono-δ-lactona) por um Kit enzimático da Boehringer. Foi ainda avaliada a actividade antimicrobiana contra duas estirpes de Staphylococcus aureus (3DA e 2LaQ) pelo método por difusão em agar ("well-assay test") e realizada a análise polínica através da contagem dos grãos de pólen dos méis por microscopia óptica. Efectuaram-se regressões lineares múltiplas entre a análise polínica e o pH, aw, fenóis e ácidos cítrico e glucónico. De forma a identificar os grupos em cada região relacionados com o conteúdo em ácidos orgânicos e com a sua identificação polínica, foi realizada análise de clusters e de componente principal (PCA). Observou-se que os méis Açorianos possuíam um pH mais baixo (entre 3,4 e 3,5), quando comparados com méis provenientes de outras regiões (entre 4,0 e 4,2). Através da regressão linear multivariada detectaram-se os ácidos orgânicos (láctico, acético, fórmico e D-málico) que mais influenciam os valores de pH (R2 = 0,764). Os méis que apresentaram coloração mais escura foram os da Nova Zelândia, Trás-os-Montes e Serra do Caramulo, sendo os mais claros provenientes da Ilha Terceira, Pico, Algarve e Alentejo. Encontrou-se uma correlação significativa entre a coloração dos méis e o seu conteúdo em fenóis (R2 = 0,500, p <0,001). Observou-se uma variação acentuada da actividade antioxidante nas amostras de mel analisadas, variando entre 4,77x10-4 μeq/mg (Alentejo) e 49,12x10-4 μeq/mg (Trás-os Montes), para o DPPH e entre 62,74 M (Alentejo) e 544,78 M (Serra do Caramulo), para o FRAP. Os méis que apresentaram maior actividade antioxidante foram os méis provenientes de Trás-os Montes e Serra do Caramulo, ambos com pólens dominantes da família Ericaceae (Urze e Azálea), a menor actividade antioxidante foi apresentada pelo mel do Alentejo (monofloral de soagem). Verificou-se uma correlação elevada entre o conteúdo em fenóis e a actividade antioxidante dos méis (R2 = 0,7309, para o DPPH e R2 = 0,7891, para o FRAP), demonstrando assim o papel dos fenóis na actividade antioxidante. Através da análise multivariada, as amostras de Trás-os-Montes, Serra do Caramulo e Nova Zelândia foram agrupadas devido à sua cor, teor em fenóis e actividade antioxidante (FRAP e DPPH). Foram identificados 83 tipos polínicos, nos quais se destacam-se 12 géneros polínicos que aparecem em maior percentagem das amostras analisadas, Pittosporum (Incenso - 94 %), Eucalyptus (89 %), não identificada (83 %), Trifolium (Trevo - 83 %), Castanea (78 %), Rubus (56 %), Poaceae (56 %), Eriobotrya (Nespereira - 50 %), Helianthus (50 %), Ligustrum (44 %), Erica (Urze - 44 %) e Tibouchina (Quaresmeira - 39 %). Observaram-se semelhanças nas espécies polínicas e composição em ácidos orgânicos, entre algumas amostras de mel provenientes da ilha Terceira e da Nova Zelândia. As amostras de mel provenientes da região Norte de Portugal Continental (Trás-os-Montes e Serra do Caramulo) apresentaram valores significativamente mais elevados (p <0,05) de ácido láctico, fumárico e glucónico. Este último pode estar relacionado com a actividade antimicrobiana do mel, devido à acção do glucose oxidase. Dos ácidos orgânicos estudados, os que melhor contribuíram para a caracterização dos méis foram os ácidos cítrico e glucónico, identificando-se respectivamente duas origens botânicas (Pittosporum e Erica). A actividade antimicrobiana detectada nas amostras de mel variou segundo a estirpe de S. aureus estudada. A estirpe de referência (2LaQ)mostrou uma maior sensibilidade às amostras de mel estudadas. Algumas amostras continuaram a apresentar actividade antimicrobiana após diluição a 25% e neutralização do pH. Observaram-se valores elevados de actividade antimicrobiana não peroxidásica (independente do H2O2), na estirpe de referência (2LaQ) em cinco amostras dos Açores (Terceira e São Miguel) e duas do Continente Português (Serra do Caramulo e Trás-os-Montes).; Several studies about the composition and properties of honey indicated that honey from different floral sources have specific antimicrobial and antioxidant properties resulting from floral origin. The Azores, with its endemic flora, is a suitable place for honey production, yet few studies are available about Azorean honey characterization. In the present study, 27 samples of honey from different Azorean islands, Portugal mainland, Australia, Argentine and New Zealand were analysed. Total phenol content was measured and antioxidant activity was determined by using the 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH•) radical scavenging method and the ferric reducing antioxidant power (FRAP). Water activity (aw), pH and color were also measured. Organic acids (formic, D-malic, lactic, acetic, maleic, citric, succinic and fumaric acids) were analyzed by high performance liquid chromatography (HPLC) and the total D-gluconic acid (free D-gluconic acid and D-glucono-δ-lactone) was determined using Boehringer enzymatic kit. In addition, the antimicrobial activity against two strains of Staphylococcus aureus (3DA e 2LaQ) was measured in an agar diffusion well-assay test and pollinic analysis was performed by pollen identification and count using optic microscopy. Multiple linear regression was performed between pollen analysis and pH, aw, phenol content, citric acid and total gluconic acid. In order to identify patterns in organic acids and pollen content of honey from each region, cluster analysis and principal components analysis (PCA) were made. Azorean honeys had a lower pH (between 3.4 and 3.5) when compared to honey from other regions (ranged from 4.0 and 4.2). This lower pH was influenced by organic acids (lactic, acetic, formic and D-malic acids) specified by multiple linear regression analysis (R2 = 0,764). The darker honeys came from New Zealand and the North of Portugal (Trás-os-Montes and Serra do Caramulo), and the lighter honeys were originated from Azores islands (Terceira and Pico) and the South of Portugal (Algarve and Alentejo). A significant correlation was found between honey colour and total phenol content (R2 = 0,500, p <0,001). A large variation in antioxidant activity was found in honey studied, ranging from 4,77x10-4 μeq/mg (Alentejo) to 49,12x10-4 μeq/mg (Trás-os Montes) in DPPH assay and from 62,74 M (Alentejo) to 544,78 M (Serra do Caramulo) in the FRAP assay. The samples from Trás-os Montes and Serra do Caramulo, with predominant pollen from Ericaceae family (Urze and Azalea), presented the highest antioxidant activity, while the lowest antioxidant activity was found in Alentejo honey (Echium spp. unifloral). A high correlation was found between total phenol content and antioxidant activity (R2 = 0,7309 for the DPPH assay and R2 = 0,7891 for the FRAP assay), indicative of the importance of phenols in the antioxidant activity of honey. Data from multivariate analysis grouped honey samples from Trás-os-Montes, Serra do Caramulo and New Zealand accounting for colour, total phenol content and antioxidant activity (FRAP and DPPH). Eighty-three pollen types were identified and twelve pollen genus were most represented: Pittosporum (Incense - 94 %), Eucalyptus (89 %), not identified (83 %), Trifolium (clover - 83 %), Castanea (78 %), Rubus (56 %), Poaceae (56 %), Eriobotrya (50 %), Helianthus (50 %), Ligustrum (44 %), Erica (44 %) e Tibouchina (39 %). Some samples originated from Terceira Island and New Zealand had identical pollen and organic acid composition. Honey produced in the North of Portugal (Trás-os-Montes e Serra do Caramulo) had a higher content of lactic, fumaric and gluconic acids (p <0,05). The latest may be related with antimicrobial activity of honey, due to the glucose oxidase activity. The organic acids that most contributed to the honey characterization were the citric and gluconic acids and these are related to two botanical origins (Pittosporum e Erica). Antimicrobial activity of different honey samples differed among the two S. aureus strains studied. Reference strain (2LaQ) was more sensitive to antimicrobial activity of honey. Some honey samples maintain antimicrobial activity after 25% dilution and pH neutralization. High values of nonperoxide antimicrobial activity of honey (H2O2 independent) against the reference strain (2LaQ) were found in five samples from the Azores (Terceira and São Miguel) and two samples from Mainland Portugal (Serra do Caramulo and Trás-os-Montes). Description: Tese de mestrado em Bioquímica, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2010

Vegetation response to Holocene climate variability in South-Western Europe

Sun, 01 Jan 2012 00:00:00 GMT

Title: Vegetation response to Holocene climate variability in South-Western Europe Authors: Oliveira, Dulce da Silva Abstract: Understanding past climate variability, especially abrupt climate events, is essential for predicting future climate, as they may provide crucial information about the climate system’s sensitivity to perturbations. Accordingly, this research is focused on documenting the vegetation response to the natural evolution of the current interglacial period, the Holocene, and on evaluating the anthropogenic contribution to it. Also, we intend to identify the nature, timing and causes of Holocene climate variability at orbital and suborbital time scales in a key region of the North Atlantic region. The present study reveals the vegetation and climate changes in southwestern France and northern Spain for the last ca. 9000 cal. yr BP in a well dated shelf core, KS05-10, retrieved in the southwestern margin of the Bay of Biscay (Basque country). The continuous high resolution pollen record shows orbital and suborbital climate fluctuations contemporaneous with those noticed for the North Atlantic region, Greenland and Europe. The gradual decline of pine and oak trees and the general increase of herbaceous plants, reflecting a gradual cooling between 9000 and 1000 yr cal. BP, follows the cooling in Greenland as well as the decrease of mid-latitude summer insolation. The gradual replacement of the oak forest by beech also reveal the reduction of seasonality, probably triggered by the gradual increase of the precession, and the increase of moisture conditions in mid- to late Holocene. Superimposed on the orbitally induced long-term cooling, KS05 10 pollen record detects an abrupt millennial scale climatic event between 8.3 and 8.1 ka in the southwestern Bay of Biscay, which is related to the well-known 8.2 ka event. The vegetation changes (reduction of temperate and humid trees, particularly Corylus, increase of ubiquist plants, principally Cyperaceae, and the presence of Carpinus) point to a cold and wet episode. The relatively cold conditions were probably the result of the weakening of the Meridional Overturnig Circulation triggered by the final catastrophic drainage of the Laurentide Lakes and consequent input of freshwater in the North Atlantic region. However this mechanism can not explain the wet conditions detected in the KS05 10 pollen record. These wet conditions could probably be the result of the influence of the Atlantic Westerly Jet stream and prevalence of strong zonal flow and frequent low pressure systems (associated with less blocking events located in the northern Iberian Peninsula and southwestern France). The blockage of sunlight by clouds, which is associated to high precipitation, may be responsible for the particular decline of Corylus (light-demanding tree) during this climatic downturn event. Small-amplitude millennial-scale cooling events after the 8.2 ka event and until the late Holocene may be reflected in the oscillations of the hazel trees. Spectral analysis of Corylus percentages shows a climatic cyclicity of ~500yr from 9 to 3 ka, comparable with those recognized in the North Atlantic region and Greenland ice cores, suggesting common climate forcing mechanisms such as changes in solar activity and perturbation of the North Atlantic circulation. The impact of human activity on vegetation over the last 1000 years is superimposed on the climatic natural changes.; O aquecimento global é na atualidade inequívoco, sendo evidentes o aumento das temperaturas médias do ar e do oceano à escala global, o degelo de neve e gelo e o aumento dos eventos meteorológicos extremos tais como: secas, cheias, ondas de calor, vagas de frio e furacões. Dada a gravidade das consequências que as alterações climáticas acarretam, o estudo destas temáticas constitui uma prioridade na agenda de diversas nações a nível socio-económico e científico. É vital, portanto, compreender o sistema climático ampliando o conhecimento sobre os mecanismos forçadores de clima e respetivas consequências nas condições climáticas no Atlântico Norte. Neste contexto, o estudo das variações climáticas registradas no presente período interglacial, o Holocénico, representa especial relevância. Estudos sobre os interglaciários e em particular sobre o Holocénico (últimos 11500 anos) são um dos principais temas de investigação atuais. Nos últimos anos foram efetuados estudos em variadíssimos registos naturais (ex. lagos, sedimentos marinhos) de modo a compreender a natureza, duração e causas das oscilações climáticas que ocorreram durante o Holocénico. Todavia, muitas das reconstituições climáticas existentes até à data, não se baseiam na correlação direta entre o oceano, o continente e o gelo, tornando difícil obter com precisão o conhecimento das interacções entre os sistemas atmosfera-oceano-continente e do seu real impato na variabilidade climática global. Acresce ainda, à impossibilidade de se estabelecer uma correlação direta, o fato de nenhum destes registos isolados ser adequado para identificar a variabilidade temporal e espacial necessária à comparação das variações climáticas regionais com modelos climáticos. Consequentemente, o tipo de mecanismos responsáveis pela variabilidade climática Holocénica está longe de ser reconhecido. Os principais objetivos deste trabalho são a) determinar e caraterizar a evolução do clima e da vegetação no Holocénico no sudoeste da margem continental Francesa/Norte de Espanha ; e b) detetar e compreender a frequência, duração e amplitude da variabilidade climática no Holocénico, assim como inferir sobre os principais mecanismos forçadores. Para tal, foi efetuado um estudo polínico de alta resolução temporal numa sondagem colhida num ponto geograficamente estratégico Atlântico Norte: norte da Península Ibérica/sudoeste da margem continental Francesa. Este estudo mostra que a vegetação na região de estudo ao longo do Holocénico respondeu à variabilidade climática orbital e sub-orbital, e em particular ao evento abrupto designado por 8.2 ka. A diminuição gradual da floresta temperada, em particular do Pinus e do Quercus decíduo, acompanhada de um aumento sucessivo de plantas herbáceas, sugere um arrefecimento progressivo compatível com a diminuição da insolação de verão das médias latitudes do Hemisfério Norte e a diminuição gradual do δ18O nos registos de gelo na Gronelândia. Durante o Holocénico médio e superior, a substituição do Quercus decíduo e Pinus pelo Fagus, sugere, além do arrefecimento progressivo, um aumento das condições de umidade e uma diminuição da sazonalidade. A redução da sazonalidade é contemporânea com o aumento geral da precessão. Superimposta a esta variabilidade climática orbital, verificou-se um episódio caracterizado pela diminuição da floresta temperada, especialmente de Corylus, juntamente com um aumento significativo das herbáceas, sobretudo Cyperaceae e a presença de Carpinus. Estes indicadores atestam a presença do evento frio e húmido designado por “evento 8.2 ka” no norte da Península Ibérica/sudoeste da margem continental Francesa. Todas as evidências apontam para os episódios terminais de expulsão dos lagos de “Agassiz” e de “Ojibway” e a consequente redução gradual da “MOC” (meridional overturning circulation), como as principais causas para o súbito arrefecimento durante o evento 8.2 ka. A diminuição da intensidade da circulação termohalina terá impedido o transporte de calor para as altas latitudes provocando a diminuição da temperatura registada no Atlântico Norte e na Europa. Este trabalho propõe que o mecanismo atmosférico que explica as condições húmidas durante este evento nas latitudes médias da Europa envolve alterações na atividade ciclónica e na posição da Corrente de Jato no Atlântico, e a prevalência de situações de forte circulação zonal com frequentes sistemas depressionários tipicos de uma ausencia de eventos de bloqueio na zona de estudo. Além disso, o aumento na quantidade de nuvens durante este evento abrupto pode ter induzido à particular diminuição de Corylus (árvore dependente de bastante luz para o seu desenvolvimento) através do bloqueio da luz solar e consequente diminuição da sua disponibilidade. A variabilidade climática sub-orbital não é muito evidente após o evento 8.2 ka no nosso registo polínico. No entanto, as percentagens de todos os taxa foram submetidas a uma análise espetral (Wavelet), de forma a determinar a evolução temporal das amplitudes e periodicidades prevalentes das variações climáticas holocénicas na região da Atlântico Norte em estudo. Foi obtida uma ciclicidade de ~500 anos para o Corylus. Esta ciclicidade é semelhante à detectada em registos na Gronelândia e no Atlântico Norte, o que sugere que esta espécie, em particular, terá respondido aos mesmos mecanismos climáticos forçadores (variações na atividade solar e/ou perturbações da circulação termohalina). Contudo, o nosso registo não possui resolução temporal suficiente para explorar esta possibilidade, sendo necessário para isso efetuar estudos adicionais. No último milénio, tornou-se evidente que o impato antropogénico através da presença contínua de espécies indicadoras de atividade antropogénica, como Castanea sativa, Juglans e cereais. O impacto humano aparenta ter sido sobreposto à variabilidade climática natural milenar durante este milénio. Este estudo contribuiu para a reconstrução das condições paleoclimáticas e a resultante resposta da vegetação ao longo do Holocénico no Norte da Península Ibérica/Sul de França; bem como para a compreensão dos mecanismos forçadores responsáveis por esta variabilidade climática orbital e sub-orbital. Os resultados desta pesquisa serão integrados nos dados existentes de alta resolução de várias regiões geográficas “chave” do Atlântico Norte incluídas no projeto CLIMHOL " Variabilidade climática Holocénica registada no Atlântico Norte e continente adjacente: correlação directa oceano-continente" (referência PTDC/AAC- CLI/100157/2008), financiado por fundos nacionais através da FCT/MCTES (PIDDAC) e co-financiado pelo Fundo Europeu de Desenvolvimento Regional – FEDER- através do COMPETE – Programa Operacional Factores de Competitividade – POFC. É importante realçar que a avaliação do tempo e a natureza de resposta da vegetação a eventos abruptos como o 8.2 ka é de particular importância pois os modelos climáticos preveem uma redução na intensidade da “MOC” devido ao aquecimento global. Em termos de investigação no futuro, pretende-se continuar a aprofundar o conhecimento dos mecanismos envolvidos nas alterações climáticas. Deste modo, é essencial detectar e compreender a frequência, duração e amplitude e os mecanismos responsáveis pela variabilidade climática natural em períodos interglaciares com condições análogas ao Holocénico, mas que não são influenciadas pelas atividades humanas. Description: Tese de mestrado em Ciências do Mar, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2012

Adsorção de cobre em matrizes naturais provenientes de depósitos do tipo RAÑA

Fri, 01 Jan 2010 00:00:00 GMT

Title: Adsorção de cobre em matrizes naturais provenientes de depósitos do tipo RAÑA Authors: Maia, Flávia Marina Serafim Abstract: O estudo dos processos de adsorção, através da elaboração de experiências de adsorção/desorção em matrizes naturais, é uma ferramenta importante para a avaliação de potenciais riscos e minimização de eventos de contaminação. As matrizes naturais utilizadas para este trabalho são provenientes de depósitos do tipo raña localizados na região de Macedo de Cavaleiros. O estudo destas matrizes têm como fim avaliar o efeito de atenuação e dispersão de metais e respectivo potencial para uso como material de retenção de resíduos radioactivos de baixa a média actividade em solos. Neste trabalho definiram-se protocolos de tratamento para caracterizar o comportamento de adsorção de Cu e avaliar o modo como as principais fases constituintes das matrizes naturais (matéria orgânica, minerais de argila e óxidos/hidróxidos de Fe) influenciam o comportamento de adsorção. Os protocolos de tratamento foram adaptados ao tipo de amostra em estudo, tendo em consideração a sua eficiência de remoção preservando a integridade estrutural dos minerais de argila. Para a caracterização do comportamento de adsorção de Cu nestas matrizes naturais foram realizados ensaios batch com Cu 2+, apenas na amostra M3R3b, na presença ou ausência das diferentes fases composicionais modificando, simultaneamente, as condições de pH. Com base nos resultados obtidos, verificou-se que as matrizes apresentam características físico-químicas e composição mineralógica semelhantes, sendo que as principais fases minerais presentes são o quartzo, ilite, montmorilonite e caulinite. A diversificação composicional e heterogeneidade da amostra M3R3b torna díficil estabelecer e avaliar o comportamento de adsorção de Cu. Neste estudo estão em jogo diversas variáveis de carácter químico e composicional que influenciam os processos de adsorção de Cu. Concluindo se que a amostra M3R3b apresenta um comportamento de adsorção de Cu pouco variável, independentemente do tratamento extractivo aplicado.; The study of adsorption processes is an important tool to evaluate the potencial hazard and minimization of contaminated events in the environment. In this type of studies it is normally necessary to elaborate adsorption/desorption experiments, which in the present work were carried out in natural matrices. The natural matrices applied in this study were collected in raña-type deposits from the Macedo de Cavaleiros region. These matrices are used to attenuate the metal dispersion, and can be used as retention materials for radioactive waste of low and medium activity in soils. In this work treatment protocols were defined for the characterisation of copper adsorption behaviour, and evaluation of the influence of the principal constituents in the natural matrices (clay minerals, organic matter and iron oxy-hydroxydes) on the adsorption behaviour. The treatment protocols applied herein were adopted to the sample type, considerating the removal efficiency while maintaining the strutural identity of the clay minerals. Regarding the copper adsorption behaviour, batch experiments with Cu2+ were performed on the M3R3b sample in both the presence and absence of the different compositional constituents, simultaneous modifying the pH conditions. On the basis of the results it was verified that the chemical and physical characterisation and mineral composition of the samples are similar. The main mineral phases present in the matrices are quartz, montmorillonite, illite and kaolinite. The adsorption of Cu in the M3R3b sample can be impeded because of the compositional diversity and the heterogeneity of the sample. As a consequence of this sample’s adsorption behavior it is very difficult to evaluated these types of processes. In this study, there are too many chemical and compositional variables that control the Cu adsorption processes. It can therefore be concluded that the M3R3b sample has a Cu adsorption behaviour that varies little and which is independent of the extraction treatment applied. Description: Tese de mestrado em Geologia (Geoquímica, Mineralogia e Petrologia), apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2010