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Título: Theoretical prediction of binding modes and hot sequences for allopsoralen-DNA interaction
Autor: Mendez, Patricia Saenz
Guedes, Rita C.
dos Santos, Daniel J. V. A.
Eriksson, Leif A.
Palavras-chave: Chemistry, Physical
Physics, Atomic, Molecular & Chemical
Data: 2007
Editora: ELSEVIER SCIENCE BV
Citação: CHEMICAL PHYSICS LETTERS. - Vol. 450, n. 40238 (DEC 14 2007), p. 127-131
Resumo: Molecular docking studies of two duplex DNA sequences as target fragments and allopsoralen as ligand were performed. The calculated interaction energies showed that the ligand can be docked into the minor groove as well as become intercalated. However, unlike psoralen, allopsoralen preferred binding mode for non-poly-TA sequences is minor groove binding. Calculated energies for intercalation between different base pairs suggest that the predicted sequence selectivity for allopsoralen is analogous to that observed for psoralen. Intercalation is favored in 5'-TpA sites in poly-TA sequences. (C) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.
URI: http://hdl.handle.net/10451/21503
DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.cplett.2007.10.105
ISSN: 0009-2614
Aparece nas colecções:FF - Produção Científica 2000-2009

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