Utilize este identificador para referenciar este registo: http://hdl.handle.net/10451/9048
Título: ThermInfo 2.0: estruturação e concretização de um sistema de informação para propriedades químicas
Autor: Reis, Roni Wilson Salomão dos
Orientador: Falcão, André Osório e Cruz de Azerêdo, 1969-
Palavras-chave: Quimio-informática
Base de dados
Sistema de informação
Propriedades químicas
MVC
Teses de mestrado - 2012
Data de Defesa: 2012
Resumo: O Grupo de Energética Molecular do Centro de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa compilou, da literatura, um conjunto de dados termoquímicos experimentais de diversos compostos químicos. Estes dados serviram de base à implementação de um sistema de informação para coligir e apresentar propriedades termoquímicas, que foi denominado ThermInfo, e encontra-se disponível em http://www.therminfo.com/. Recentemente o Grupo de Energética Molecular compilou mais dados de compostos químicos orgânicos, sendo que estes dados possuem novas propriedades para além das termoquímicas. Ficando comprometida a integração desses novos dados no sistema ThermInfo, estruturou-se a proposta deste trabalho: a estruturação de uma base de dados para propriedades químicas de compostos orgânicos, e a sua concretização no sistema ThermInfo, passando assim a ThermInfo 2.0, e por fim a reestruturação da arquitectura do sistema, separando o acesso aos dados da visualização dos mesmos. Este projecto integra quatro fases de desenvolvimento interdependentes e complementares: percepção (análise do problema e de requisitos), concepção (modelação da base de dados), implementação e avaliação. A base de dados foi baseada numa especificação de dados relacional para descrever propriedades estruturais e químicas de compostos orgânicos e aplicada ao ThermInfo 2.0. Presentemente, a base de dados contém cerca de 30998 valores de propriedades, divididos por 20 propriedades químicas, para cerca de 11290 compostos orgânicos únicos e não redundantes. Foi adoptado o modelo MVC (Model-View-Controller) para a nova arquitectura do sistema, que foi implementado através de um framework PHP (CodeIgniter). Os resultados da avaliação da base de dados e do sistema indicaram que estes são eficientes, em termos de tempo de execução e utilização de memória do servidor. O desenvolvimento deste trabalho sugere algumas direcções futuras que irão ampliar as capacidades do sistema ThermInfo 2.0, nomeadamente a expansão do conjunto de dados integrando outras classes de compostos químicos, outros tipos de pesquisas na base de dados (InChI), e a construção de um Web Service.
The Molecular Energy Group from the Chemistry and Biochemistry Center, Faculty of Science, University of Lisbon gathered, from literature, a data set of experimental thermochemical from several chemical compounds. These data were the basis for the implementation of an information system to collect and present structural and thermochemical properties of organic compounds, which has been named ThermInfo, and is available at http://www.therminfo.com/. Recently the Molecular Energy Group has gathered more data of organic compounds, and these data have new properties in addition to the thermochemical. With problems to integrating these new data on the ThermInfo, the proposal of this work was structured: structuring a database for chemical properties of organic compounds, and its realization in the ThermInfo system, thus updated to ThermInfo 2.0, at last restructuring the system architecture, separating the data access from visualization. This project includes four interrelated and complementary phases of development: perception (problem and requirements analysis), design (database modeling), implementation and evaluation. The database was based upon a relational data specification to describe structural and chemical properties of organic compounds and applied to ThermInfo 2.0. Currently, the database contains about 30998 property values, divided by 20 chemical properties, for about 11290 unique and non-redundant organic compounds. It was adopted the MVC model (Model-View-Controller) for the new system architecture, which was implemented through a PHP framework (CodeIgniter). The evaluation results of the database and the system show that they are efficient, in terms of runtime and memory usage. The development of this work suggests some future directions that will expand the capabilities of the ThermInfo 2.0 system, including the expansion of the data set with the integration of other classes of chemical compounds, other types of searches on the database (InChI), and implementation of a Web Service.
Descrição: Tese de mestrado em Tecnologias de Informação aplicadas às Ciências Biológicas e Médicas, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2012
URI: http://hdl.handle.net/10451/9048
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